
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探究结局
与探讨人士与探讨渐渐冷库时延缓至牛羊肉的氏硬性、持反击式水轮机、质地、分离态铁分子量、ROS、脂质过氧化反应物、MDA、GSH和GPX4水平方向来评诂手臂肌肉组识组织肿瘤细胞的铁枯死情况下。但是表明,冷库时延缓至后,牛羊肉的氏硬性在第5天和第6天特殊走低;持水力减小;茶汤颜色变深,失掉亮光,鲜朱大红色化为暗朱大红色。不仅如此,分离态铁、催化活性氧和MDA的分子量特殊新增,组织肿瘤细胞凋亡率特殊偏高。 研究方案工作人员提现不一冰箱南北朝时期的肌肤合格品的蛋清酶质,然而做好SDS-PAGE探讨,蛋清酶质条带在不一南北朝时期划分平滑且同类(图1a)。按照其蛋清酶在不一合格品中的表明现象,探讨表明同样一组合格品的中六位数比较敏感于同样一平行(图1b),代表肌肤合格品蛋清酶质具备有好的组内同类性和组间距离性。 核淀粉酶组学共监定出1996种核淀粉酶。以B0为對照组,建立B1、B2、B4和B6中的核淀粉酶参与不一致性描述深入数据分析,共监定到379个DEPs。将火山图大数据可视化,并会按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.055个要求深入数据分析DEP。后果如同1c-f已知,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别监定出22、33、73和140个DEPs,中间分刘海别上浮6、11、32和89个,变动16、22、41和53个。聚类分析法具体方法鉴定了各个冷藏箱的阶段肌策划 中核淀粉酶的描述,后果表现肌核淀粉酶描述不一致性根据处理时间间隔的不断新增而不断新增(图1g)。
图1| 的不同冷藏库时段的背部肌肉土样膳食纤维质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 对比速冻日期的肌肤样件对比蛋白酶概述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁伤亡淀粉酶肽的PRM定量介绍介绍(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 源于KEGG含有对比分析表达出来淀粉酶的铁伤亡规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT酶联免疫法蛋清质组学技艺服務,拜谱生态学已新物品研发提交并成立了建立健全发育成熟的转录组学、蛋清组学、消化吸收组学相应几组学合力物品技艺服務指标体系,欢迎致电咨询!
规范论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.