
近日,成都医科读书首所属卫生院王学浩中科院院士创业团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向疗法能力代谢率检测分析服务。
因为一级标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名字网站标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
买家公司的:南京医科大学
论述的原材料:细胞
拜谱保证服务的:转录组测序+蛋白质互作组+靶向药物能量是什么消化吸收组
技术工艺风格:
设计最终结果
01、YBX1被认定为HCC中糖酵解的关键点基因遗传
本研究阐述采集工具HCC癌症模板(n=7)的单血神经元RNA测序资料集对其进行阐述,感觉糖酵解几丁质酶主要是集中点在癌症血神经元中,hdWGCNA阐述自动识别出9个什么是基因电源模块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的存活阐述确实YBX1为独立性存活投资风险环境因素(图1H)。进每一步配合IHC、WB实验操作和癌症团队与附近非癌症团队的区域空间转录组学资料集核实YBX1是肝血神经元癌方法的未知靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被明确为上下调整HCC细胞膜糖酵解的要素元素
02、YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物动能消化吸收组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1组合并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1根据并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化明显增强其磷硝化作用,为了利于其核转位
继续一个脚印验测YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是决定其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC癌细胞核中或用OGT抑制作用剂OSMI-1解决,YBX1淀粉酶情况取得降低,YBX1磷酸性反应取得缩短(图4A-C)。IP实验报告体现,在一样的的Flag-YBX1底物情况下,YBX1-WT的磷酸性反应情况取得过于YBX1-T57A,阐明磷酸性反应的提高既仅是因更好的YBX1淀粉酶表达方法出(图4D)。分離了核和质酚类化合物表明TMG解决的HCC癌细胞核中YBX1核表达方法出的增高(图4E-F),继续一个脚印表明YBX1磷酸性反应的的关键调整指数公式是AKT(图4G-I)。此类表明注重O-GlcNAc糖基化经过驱动其磷酸性反应来资料YBX1淀粉酶可靠稳定性分析高性并驱动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖不有助其进十步进行磷硝化作用遮盖并并能增强其核转位
05、YBX1有利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促进会PKM2转录
06、YBX1 就能提升组淀粉酶乳过酸绘制层次
深入分析发现了YBX1敲低重要减少血清质乳过酸,还是比较是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解压制性剂2-DG的进行实验表明了糖酵解与组血清乳过酸的同时关连,压制性糖酵解可重要减少H3K18la程度(图6D)。PKM2过展现不可逆转转YBX1敲低所至的H3K18la急剧下降,之外源乳酸外理实际上提高H3K18la,还跟随YBX1展现上浮,表示长期存在正在向回访(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR表明,H3K18la能够 含有于YBX1再启动子同时加速其转录,该的过程 受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),高并发现了P300 上浮是YBX1强化H3K18乳酰化为用的长效机制(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳酸性反应呈现技术水平
散文工作小结
在一项研究分析中通讯稿了YBX1在HCC中高表述,或者与糖酵解密码切相应的。YBX1在T57处被O-GlcNAc掩盖,为了安稳血清质并提高其表述。相应种掩盖还推动YBX1在T57处的磷碱化,推动其核易位。因,相应具体步骤不断增强了糖酵解相应的人类dna的转录并刺击乳酸的会产生。除此之外,YBX1修改密码P300的转录,以致推动组血清的乳碱化,十分是H3K18la,H3K18乳碱化正方向调整YBX1人类dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隐性基因双面馈环机能图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物工程为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向治疗卡路里排泄组技术服务,拜谱生物工程建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、翻译工作后绘制组学、排泄组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
符合文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.