
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应修饰语血清组学产品,实现1000+玄之又玄度突显位点检测,安稳重新精选靶点,全多方面生信分折解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“出现 ”到“验正”全工艺流程精准服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、实验性具体流程
02、测量信息
03、经“点”重演
在场地实测数据统计中,检测出2个资料中简报的经典爱情靶点极其衣康酸掩盖位点,如首要个被察觉到的衣康酸共价掩盖血清质KEAP1,还糖酵解通道中的3个重要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,包括炎性小体结构血清质NLRP3和细胞核细胞坏死过程中中的重要血清质RIPK3等,其质谱图给出图所显示。
04、好产品显著特点
1.几斤质控
行业化特喜欢的人在线测试器孵育、SDS-PAGE在线测试、WB检验、范本关联性剖析等各个位在线测试,抓实项目流程结局不靠谱性。2.高使用性能质谱机器设备服务平台
在Orbitrap Astral全新那代高辨认质谱仪作明佛母心咒下,建立衣康过酸装饰位点及蛋清技术鉴定新深度.,机械助力完美探究新看到。3.全流程步骤一走式售后服务
立于拜谱生物技术完整的进行实验APP,可能提供“组织训练→探头孵育→WB查重→举重若轻度衣康酸性反应修饰语查重→vip专享生信进行分析→对应位点PRM证实”全步骤功能,省时省时更省时。05、深入分析游戏内容(这部分)
06、选用方法
PART 2、文章每日分享
资料一
用英文怎么说一级标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
简体中文标题文字:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
研发文章:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
论文资料二
英文翻译文章标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
英文版标题文字:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
研究分析內容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、案列研究指导思想
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备着较为强烈的底物紧密联系的能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱菌物衣康过酸体现组试验资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应绘制(如表图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结
看做TCA再循环中的中部排泄率物,衣康酸调高排泄率、免役和细菌感染直接的双方用途,为手术根治免役细菌感染性病给出了取代手术根治战略。衣康酸组成中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸组成能对蛋白质含量酶质上的亲水性半胱氨酸残基开始烷基化表达语(迈克尔增益症状),此种翻译英语后表达语被喻为“衣康酸表达语(itaconation)”,从根本上损害蛋白质含量酶质用途,调空免役回复和排泄率途经,为种病抗癫痫药物创新给出新一个构想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸遮盖血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物中医药学坚决定量分析靶向治疗产生组(QMT1000)或能量消耗分泌靶向药物分泌组品牌对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
关联性文章
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.