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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于表面抗原外来物种特情人、寡核苷酸遮盖成本预算激昂或作业工作流程缜密。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教学精英团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低料工费、跨鱼类、全手机平台兼容的全新解决方案。

杂志介绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国科学实验有效的院隐性基因的与发育期菌物学探析所和我国隐性基因的都了解承办的国际级学术界论述中文核心杂志杂志论文,纷纷致力于于报导生命力科学实验有效的和医药学隐性基因的学的教育科技领域的创作者性探析技术成果。JGG 202多年度印象细胞7.1,Scopus学术界论述中文核心杂志杂志论文品评招生指标CiteScore 9.9,排名第JCR 202多年度GENETICS & HEREDITY的教育科技领域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY的教育科技领域Q1区,排名第我国科学实验有效的院中文核心杂志杂志论文系统分区菌物学类别1区(Top中文核心杂志杂志论文),隐性基因的学和动物化学与碳原子菌物学小类双1区。

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什么东西是HEATag

婉转的“二合并”规划

HEATag是由凝集素和HUH内切酶定义的融和淀粉酶

「追踪定位器」输出模块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化装饰(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连入器」控制模块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)引索方形码通过共价进行连接。

“1+1>2”的目的:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行子样本标签与可追溯。

Fig1: HEATag多方面标注原里举手图

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进阶篇检验检测

HEATag算是有点能打?

可以在有所不同先决条件下,体现喂乳绿色体神经细胞系单体神经细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。研究方案销售团队为 HEATag 设施了多轮 “工作压测英文”,从上皮内部系到上皮内部核,从超低温到超低温,从新鲜样板到紧固样板,全东南方向查证它的动态平衡性和不靠谱性。

1、轮公测重要性乳期昆虫血細胞系:实验员工首选了存在人、鼠、仓鼠这三个植物鱼类的每种血細胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在高温下要 HEATag 箭头后混后测序。最终能够收旧的 11447 个血細胞中,85.66% 都能能够 HEATag 条型码为准连接到原植物鱼类,样表间对称空气污染特少,UMAP 聚类算法了解也是直观认定书,HEATag 条型码与植物鱼类特异形基因遗传组的特征高速相符。 随后,检验能力加强组织领导一个脚印自动升级:研发工作员战胜困难在 4℃下箭头最新度受损細胞、在制冷下箭头甲醇统一受损細胞,几乎直接性箭头受损細胞核。报告从未显眼:其它能力下,模板标贴与种类信心均有挺好的相关内容性,拆成正确率超 95%。然而甲醇统一会引起少少的转录本交叠破坏,受损細胞核制法能有多量 RNA 轻易流失,受损細胞类形的注解报告从未与最新度模板控制不一,关系证明 HEATag 能箭头不一样的治疗能力下的实验所模板。

Fig2: HEATag 可在差异要求下到位单細胞转录组混样分析一下

够标记图片哺乳期部分食草动物和海洋能无脊椎神经部分食草动物的原代上皮细胞

如说企业系检查是 “前提题”,那企业子样本量就 “扣减题”, 以上子样本量一般因企业类形繁杂、环境改变性专项 ,成为了记号技能的 “薄弱点”,而 HEATag 刚好在以上 “薄弱点” 上能够 了的优势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组识,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞仅仅能被准确无误分,其它主要是细胞核种类的聚类算法成果都清淅可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋能生物体的适用性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与种群转录组都具有较高相符性,如果没有会出现因高盐工作环境导致的 “标上没有效果”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可实现目标辅乳期猎物组识样品各种方面 scRNA-seq 研究

Fig4: HEATag可构建新鲜松茸海洋资源无脊梁骨家禽众多 scRNA-seq 介绍

HEATag与组织细胞的配合不会轻易产生转录组的重要变更

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完整标上每日任务的时,也不会对之后的转录混合物析出现干预,确认了深入分析动态数据的实际存在性。

Fig5: HEATag不可能导致范本的 RNA 展现模式英文

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之后可期

HEATag 能为单上皮细胞研究分析介绍任何?

HEATag 的币值,远不停于 “满足图标疑问”,它的协调性性和普遍意义,还在为单血细胞研究方案访问更好也许性

从应该用场景中分析

HEATag 能铺盖从 “很简单对比进行分析”(如癌策划 与正常人策划 、药物剂量清理与差表)到 “大面积探究”(如策划 组织图谱编写、高通骁龙量选择)的全面积诉求。伴随 PIP-seq、Stereo-cell 等新可映射技巧的发展方向,HEATag 还能进一个步骤优化单组织探究的通量,推助科技创新销售团队搞好不大面积的工程。

从跨方面竟争力看看

HEATag 实际上应适用转录组学,还能与表观遗传基因组学、血清质组学、办公空间组学等技艺融合,按照订制目录和寡核苷酸队列,HEATag 都还能够容易加入不同的的组学环节,不影向卫星信号抓取深层次。与此同时,通过HEATag还都还能够进步单癌细胞糖组学研发技艺。

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联合最新

拜谱生物体与陈凯讲解实现过程合作项目意料之外

有必要了解的是,在 HEATag 水平体出现非常大的运用成长性的背景图案下,拜谱海上动物已与我国南部海上科学有效与工程建筑全国工作任务室(长沙)陈凯讲师形成最初始合作关系有意向。两人工作任务计划着力 HEATag 水平的第三工业化落实、教育科研管理开发转成等角度伸展深度.通力合作,积极推动这个低代价、跨种群的单癌受损细胞膜箭头水平速度快运用于实践教育科研管理开发场景设计,为较多工作任务室出具高效益、实惠的单癌受损细胞膜的研究交通工具,助推教育科研管理开发工作任务者在癌受损细胞膜海上动物学、海上海上动物学、消化道疾病规则等方向认定较多突破点
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